Sejarah berdirinya sekolah-sekolah Santa Maria di Pekanbaru diawali dengan berdirinya TK Santa Maria Pekanbaru pada tahun 1953. Pada saat itu TK Santa Maria didirikan di Batu Satu Jalan Raya Bangkinang yang saat ini menjadi Jalan Ahmad Yani- Pekanbaru. Berdirinya Taman Kanak-kanak ini adalah hasil dari semangat yang luar biasa dan tidak kenal lelah dari para Pastor (biarawan) Xaverian pada saat itu, yaitu: Pastor R.Danielli,S.X dan Pastor Nardello,S.X. Perkembangan sekolah TK begitu pesat karena di zaman itu belum banyak kompetitor.
Setelah berdirinya TK dan dengan perkembangan jumlah murid yang pesat, para Pastor mulai berpikir kemana para murid lulusan TK Santa Maria ini akan melanjutkan sekolahnya?. Akhirnya pada tahun 1956 berdirilah SD Santa Maria yang berlokasi di Jalan Raya Bangkinang itu juga.
Dengan metodologi pengajaran yang unik serta disiplin dari para guru yang tinggi, akhirnya banyak orang tua yang saat itu mempercayakan anak-anak mereka bersekolah di TK dan SD Santa Maria. Ini jelas menjadi bahan pertimbangan oleh Yayasan Prayoga perwakilan Riau Daratan untuk mengembangkan lagi hingga tingkat SMP. Akhirnya pada tahun 1961 berdirilah SMP Santa Maria Pekanbaru yang berlokasi di sebelah SD Santa Maria.
Nama sekolah Santa Maria sebagai sekolah yang memiliki disiplin yang tinggi semakin bersinar saat itu, namun belum ada SMA. Maka akhirnya di tahun 1975 dengan menumpang ruangan di bawah Gereja Santa Maria A Fatima, SMA Santa Maria pun berdiri. Tahun 1976 SMA Santa Maria resmi pindah ke gedung baru berlantai dua yang dirancang dan dibangun oleh Pastor Aldo La Ruffa, S.X di Jalan Ronggowarsito Pekanbaru.
Akhirnya melalui perjalanan waktu SMP Santa Maria pun dipindahkan di kompleks sekolah SMA Santa Maria di Jl.Ronggowarsito hingga saat ini. Lulusan demi lulusan telah dihasilkan, mereka melanjutkan sekolah, melanjutkan kuliah atau mungkin melanjutkan bisnis orang tua mereka.
Yang jelas para lulusan Sekolah Santa Maria ini pasti tidak akan lupa dengan nilai-nilai (values) yang ditanamkan pada saat mereka belajar di sekolah. Nilai-nilai Disiplin, Integritas, Tanggung jawab yang tidak akan pernah lekang oleh waktu dan ini menjadi Memori Indah untuk dibagikan ketika mereka berkumpul lagi bukan sebagai seorang siswa, namun sebagai seseorang yang telah menjadi manusia seutuhnya.
